RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 ERVFC1-1P60608 527 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 C7orf69Q9H7B7 122 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC79Q9P2D8 2635 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 AKAP9Q99996 3911 aa15.96■□□□□ 0.15
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF320A2RRD8 509 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV1-69P01742 117 aa15.96■□□□□ 0.15
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PACSIN3-211ENST00000539589 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACSIN3-211ENST00000539589 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.94■□□□□ 0.14
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PACSIN3-211ENST00000539589 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 Q96MF0 132 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX15Q9BXT5 2789 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC17A3O00476 420 aa15.93■□□□□ 0.14
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PACSIN3-211ENST00000539589 NDPQ00604 133 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
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PACSIN3-211ENST00000539589 Q8N9W7 124 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 THYN1Q9P016 225 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ISLRO14498 428 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TOMM40O96008 361 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 MGST1P10620 155 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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PACSIN3-211ENST00000539589 HIST3H2BBQ8N257 126 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00479Q96M42 142 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM14CQ9P0S9 112 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 EPDR1Q9UM22 224 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 HECTD1Q9ULT8 2610 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PGPA6NDG6 321 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GNG7O60262 68 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 HLA-DRB1P01911 266 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL15P61313 204 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GFI1BQ5VTD9 330 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GATA3P23771 443 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF600Q6ZNG1 722 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TGFAP01135 160 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 BAGE2Q86Y30 109 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR61Q9BZJ8 451 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PIFOQ8TCI5 191 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM68Q96MH6 324 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2G1P62253 170 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GNG5P63218 68 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM183BQ1AE95 376 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PDZD11Q5EBL8 140 aa15.88■□□□□ 0.13
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