RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 TRGC2P03986 189 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGF1P05019 195 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ATP5J2P56134 94 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 C1orf194Q5T5A4 169 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 NECAP1Q8NC96 275 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 RNF125Q96EQ8 232 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 DERL1Q9BUN8 251 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MLST8Q9BVC4 326 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 V9GYV3 84 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ABCA1O95477 2261 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CACNA1BQ00975 2339 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TMEM89A2RUT3 159 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 F8W735 103 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 K7EQM0 130 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 REG1AP05451 166 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MSMBP08118 114 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TRGC1P0CF51 173 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGLC2P0DOY2 106 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ORM2P19652 201 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PSG9Q00887 426 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 RPEL1Q2QD12 228 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MBD6Q96DN6 1003 aa5.92□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 A0A087X0K7 114 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PPQ1 181 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF98A6NK75 572 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 K7EN84 100 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 BMPR1BO00238 502 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 LTAP01374 205 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TCRAP04437 139 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ESDP10768 282 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 COX6B1P14854 86 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 DLX1P56177 255 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ERVFC1-1P60608 527 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 UBE2G1P62253 170 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 NDPQ00604 133 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MORN5Q5VZ52 161 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 BAGE2Q86Y30 109 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF843Q8N446 348 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TEX29Q8N6K0 151 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 FRZBQ92765 325 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 USMG5Q96IX5 58 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.462e-8■■■■□ 20.8
PACS1-211ENST00000531298 A0A096LNT2 108 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 A0A0U1RQK1 487 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF320A2RRD8 509 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PGPA6NDG6 321 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGHG2P01859 326 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HLA-DQA1P01909 254 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CTSGP08311 255 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PYYP10082 97 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 LYZP61626 148 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 Q6AWC8 147 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZFP82Q8N141 532 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 Q9H3A6 140 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.9□□□□□ -1.46
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