RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 CGREF1Q99674 301 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PYGO2Q9BRQ0 406 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GINS4Q9BRT9 223 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SELENOIQ9C0D9 397 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GTSF1LQ9H1H1 148 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 BET1LQ9NYM9 111 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL20Q9NYY1 176 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 FRRS1LQ9P0K9 344 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNX12Q9UMY4 172 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 U3KQE9 123 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A087WWC5 75 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A087WZ39 114 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 A6NN06 94 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM262E9PQX1 116 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 I3L2K1 104 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 J3KRW8 73 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CORTO00230 105 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 BUB3O43684 328 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITM2AO43736 263 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPINK4O60575 86 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNNO75324 88 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDCD6O75340 191 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 WBP4O75554 376 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNAPC5O75971 98 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 DIRAS1O95057 198 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFAIP8O95379 198 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM50AO95807 157 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD2P06729 351 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPSAP08865 295 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SFTA3P0C7M3 94 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC2A5P22732 501 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OPRK1P41145 380 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS10P46783 165 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GALR1P47211 349 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERHP84090 104 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 WT1-ASQ06250 92 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 FLOT2Q14254 428 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF876PQ49A33 203 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCOTHQ58A44 107 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEDAGQ5VYS4 303 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 AWAT2Q6E213 333 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GLYATQ6IB77 296 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR27Q6MZM9 219 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CGB2Q6NT52 195 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF546Q86UE3 836 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 NIT1Q86X76 327 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 IQCF2Q8IXL9 164 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35F2Q8IXU6 374 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR8I2Q8N0Y5 310 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 BPIFCQ8NFQ6 507 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2T12Q8NG77 320 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4C5Q8NGB2 326 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 LHFPL5Q8TAF8 219 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM162AQ96A26 154 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCUR1Q96AQ8 359 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 DERL3Q96Q80 235 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 FMO2Q99518 471 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBX5Q99593 518 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC50A1Q9BRV3 221 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PBDC1Q9BVG4 233 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIXL1Q9H2W2 232 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMBIM4Q9HC24 238 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM138Q9NPI0 162 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 C8orf4Q9NR00 106 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 FKBP11Q9NYL4 201 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNG8Q9UK08 70 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A096LNI7 61 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1W2PP11 408 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 METTL15A6NJ78 407 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 A8MTW9 85 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR32B1ATL7 298 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRAC2D3DTV9 90 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7EPK0 472 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 UPK2O00526 184 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGS13O14921 159 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC22A5O76082 557 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLPIP03973 132 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMGN1P05114 100 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 NQO2P16083 231 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CELP19835 753 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCKP27707 260 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 HLA-DMAP28067 261 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A7P31151 101 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 HRH1P35367 487 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP6V1E1P36543 226 aa1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms