RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-212	ENST00000515746	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PPI3	338 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4C46	A6NHA9	309 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		A8MWL6	223 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		M0QZ24	198 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		M0R1B8	84 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	NKX2-8	O15522	239 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV2-11	P01706	119 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PPBP	P02775	128 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TCRA	P04437	139 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CRYGB	P07316	175 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CAMP	P49913	170 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	HES3	Q5TGS1	186 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01545	Q5VT33	79 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DHRS13	Q6UX07	377 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		Q86TA4	180 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PDPN	Q86YL7	162 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB125	Q8N687	156 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RND1	Q92730	232 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PERP	Q96FX8	193 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FMC1	Q96HJ9	113 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LOXL4	Q96JB6	756 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	C16orf92	Q96LL3	132 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	HARBI1	Q96MB7	349 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OTOR	Q9NRC9	128 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	hDV102S1	A0JD36	115 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PGP	A6NDG6	321 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CEACAM4	O75871	244 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PLAU	P00749	431 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		P01737	135 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LIPF	P07098	398 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	MPV17L2	Q567V2	206 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR31	Q5SQ13	230 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	NUP37	Q8NFH4	326 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DPF1	Q92782	380 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RITA1	Q96K30	269 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		U3KQK5	164 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CAD	P27708	2225 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PLCE1	Q9P212	2302 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	KNTC1	P50748	2209 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GW15	77 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX22	C9J3V5	150 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CD5L	O43866	347 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LEPROTL1	O95214	131 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	NUDT3	O95989	172 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	COX8A	P10176	69 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FGF6	P10767	208 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL3L1	P16619	93 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CD24	P25063	80 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CD40	P25942	277 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LGALS7	P47929	136 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL11	P51671	97 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXE3	Q13461	319 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	MUC21	Q5SSG8	566 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		3.94	□□□□□ -1.78

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