RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM133Q9H2Q1 129 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RERGLQ9H628 205 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC167Q9P0B6 97 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB22AQ9UL26 194 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 POMPQ9Y244 141 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PQLC2LA1A4F0 135 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ERICH4A6NGS2 130 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 GGT3PA6NGU5 568 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 EFCAB9A8MZ26 197 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R2N4 97 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MPZL2O60487 215 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF682O95780 498 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CST4P01036 141 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1D-33P01593 117 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1-33P01594 117 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 P0C880 135 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 KDELR2P33947 212 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNGR2P38484 337 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 REG1BP48304 166 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CXCR4P61073 352 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PSME3P61289 254 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PCBD1P61457 104 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 HAMPP81172 84 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TMED1Q13445 227 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM69Q5SWH9 247 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MINOS1Q5TGZ0 78 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM42Q69YG0 159 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 GLYATQ6IB77 296 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ADM2Q7Z4H4 148 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DCXRQ7Z4W1 244 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35E3Q7Z769 313 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP4Z1Q86W10 505 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB107AQ8IZN7 70 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF439Q8NDP4 499 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR51D1Q8NGF3 324 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10A6Q8NH74 314 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF133Q8WVZ7 376 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SLAMF6Q96DU3 332 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TVP23CQ96ET8 276 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PYURFQ96I23 114 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 KCTD7Q96MP8 289 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RBP7Q96R05 134 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PRRG3Q9BZD7 231 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 NDEL1Q9GZM8 345 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCG5Q9H222 651 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM206AQ9NX38 181 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CMTM6Q9NX76 183 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 USE1Q9NZ43 259 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BAIAP2Q9UQB8 552 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 KLF12Q9Y4X4 402 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 AP4S1Q9Y587 144 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ENPP4Q9Y6X5 453 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SSPOA2VEC9 5147 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MUC17Q685J3 4493 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CENPXA8MT69 81 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 C5orf58C9J3I9 102 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 J3QT63 122 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CXCR6O00574 342 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB4AO15263 64 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 FGF16O43320 207 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DENRO43583 198 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ENTPD6O75354 484 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 E2F6O75461 281 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 P01737 135 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RBP4P02753 201 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TTRP02766 147 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CDK2P24941 298 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RANBP1P43487 201 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BLVRAP53004 296 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS2R41P59536 307 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 EDDM3AQ14507 147 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CDK5R1Q15078 307 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNJ8Q15842 424 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DRAM2Q6UX65 266 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa1.53□□□□□ -2.16
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