RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 MEIKINA0A087WXM9 373 aa2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 GGT3PA6NGU5 568 aa2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 C17orf51A8MQB3 221 aa2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 GGTLC3B5MD39 225 aa2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 CLDN25C9JDP6 229 aa2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 F6UZH7 168 aa2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 SYNGR2O43760 224 aa2.79□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 MORN2Q502X0 79 aa2.79□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.79□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 IL36BQ9NZH7 164 aa2.79□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 ZFP30Q9Y2G7 519 aa2.79□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 USP54Q70EL1 1684 aa2.79□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa2.78□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 SOD1P00441 154 aa2.78□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 CASP1P29466 404 aa2.78□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 EVX1P49640 407 aa2.78□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 FOXA1P55317 472 aa2.78□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 MAXP61244 160 aa2.78□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 LGALS9BQ3B8N2 356 aa2.78□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 AADACL3Q5VUY0 350 aa2.78□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 LGALS9CQ6DKI2 356 aa2.78□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.78□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 KIF13BQ9NQT8 1826 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 VCANP13611 3396 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 LMO7Q8WWI1 1683 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.77□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 RIIAD1A6NNX1 92 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 K7EM74 188 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 CORTO00230 105 aa2.77□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 NCS1P62166 190 aa2.77□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 ERG28Q9UKR5 140 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 CHD5Q8TDI0 1954 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 PXDNLA1KZ92 1463 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 ATP7BP35670 1465 aa2.77□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 LY75O60449 1722 aa2.76□□□□□ -1.97
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