RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 Q8TCH9 128 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 A8MWP6 167 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 UBE2E1P51965 193 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 H3BTX0 84 aa11.16□□□□□ -0.62
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NISCH-207ENST00000479054 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 IGLV3-1P01715 115 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CGAP01215 116 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CD24P25063 80 aa11.16□□□□□ -0.62
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NISCH-207ENST00000479054 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CENPWQ5EE01 88 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GWB2 263 aa11.15□□□□□ -0.62
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NISCH-207ENST00000479054 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 GZMBP10144 247 aa11.15□□□□□ -0.62
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NISCH-207ENST00000479054 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.15□□□□□ -0.62
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NISCH-207ENST00000479054 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.14□□□□□ -0.63
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NISCH-207ENST00000479054 ATP5G3P48201 142 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 EMP1P54849 157 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 CR1LQ2VPA4 569 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 TMEM219Q86XT9 240 aa11.14□□□□□ -0.63
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NISCH-207ENST00000479054 SAA4P35542 130 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 ABCA4P78363 2273 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.13□□□□□ -0.63
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NISCH-207ENST00000479054 C15orf32Q32M92 178 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 C5orf30Q96GV9 206 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 HBBP68871 147 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 MBD3L1Q8WWY6 194 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 VSIRQ9H7M9 311 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 WIPF3A6NGB9 483 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.12□□□□□ -0.63
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NISCH-207ENST00000479054 A0A0G2JRQ6 117 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 C7orf71A4D174 169 aa11.11□□□□□ -0.63
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NISCH-207ENST00000479054 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 H0YJW9 148 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 NPSP0C0P6 89 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZR03 302 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZRM9 215 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 LINC00205P59089 165 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 TREML4Q6UXN2 200 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 KIR3DL3Q8N743 410 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 PRO3102Q9H379 93 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 LIME1Q9H400 295 aa11.1□□□□□ -0.63
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