RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468108.1

CCDC66-211, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-211	ENST00000468108	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	NPB	Q8NG41	125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	TACC2	O95359	2948 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108		A0A096LNT2	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108		F6UZH7	168 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108		H7BYZ3	331 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	PHOX2A	O14813	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC25A17	O43808	307 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	YIF1A	O95070	293 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	NDUFA3	O95167	84 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	CEBPG	P53567	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	RUNX1	Q01196	453 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108		Q8N6K4	173 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ARID1A	O14497	2285 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	CR1	P17927	2039 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108		A0A1B0GV50	99 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108		A0A1W2PRD5	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108		A0A1W2PRF3	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108		A0A1W2PRM7	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108		H3BP45	60 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	NBR2	O15453	112 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	TGFA	P01135	160 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	DDT	P30046	118 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	SAA4	P35542	130 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	GALR1	P47211	349 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	HES1	Q14469	280 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	PRSS8	Q16651	343 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	COX19	Q49B96	90 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCDC66-211	ENST00000468108	FRZB	Q92765	325 aa		4.06	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms