RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 ZNF134P52741 427 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 TNXAQ16473 311 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 NRGNQ92686 78 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 TIMD4Q96H15 378 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-210ENST00000453727 PSMB11A5LHX3 300 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 H0Y980 276 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CX3CL1P78423 397 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 RAB1CQ92928 201 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 PERPQ96FX8 193 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 RAB9BQ9NP90 201 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 A0A0G2JLM5 398 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 hDV102S1A0JD36 115 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 BMPR1BO00238 502 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 REG1BP48304 166 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 FA2HQ7L5A8 372 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ZNF714Q96N38 554 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 VPS13CQ709C8 3753 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 POLQO75417 2590 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 A0A1W2PPV4 95 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 C2orf70A6NJV1 201 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 IGHV4-39P01824 125 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 AMY1AP04745 511 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 LINC00205P59089 165 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 BLNKQ8WV28 456 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CACNG5Q9UF02 275 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 A0A0G2JRQ6 117 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 PROP1O75360 226 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CLEC3BP05452 202 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 GPR12P47775 334 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM177Q53S58 311 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 LINC00473A8K010 186 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 OR11H12B2RN74 326 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 IGKV1-39P01597 117 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 IGKV1D-39P04432 117 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CRYGCP07315 174 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 FABP2P12104 132 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 DLX6P56179 175 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SLC35B1P78383 322 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ZNF585BQ52M93 769 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 OR11H1Q8NG94 326 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 OR11H2Q8NH07 326 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM189A5PLL7 270 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ISLRO14498 428 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CD1BP29016 333 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ATP5J2P56134 94 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 KRTAP10-9P60411 292 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 V9GYV3 84 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 C17orf98A8MV24 154 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms