RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 C15orf32Q32M92 178 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 TRGV9Q99603 122 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 GNB4Q9HAV0 340 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 I3L521 148 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 OVOL1O14753 267 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 YIF1AO95070 293 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 IGKV1-17P01599 117 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 TRGV3P03979 118 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 NMBP08949 121 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00869P0C866 280 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 OR10J1P30954 320 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 TPPP2P59282 170 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 SERF2P84101 59 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF616Q08AN1 781 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 MIC13Q5XKP0 118 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 STPG3Q8N7X2 389 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 CXorf58Q96LI9 332 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 MS4A10Q96PG2 267 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 ATP6V0BQ99437 205 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 KLK15Q9H2R5 256 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 S4R3C0 116 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1B0GVY2 172 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 NUPR2A6NF83 97 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 ZFP92A6NM28 416 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 UMAD1C9J7I0 102 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV3-23P01764 117 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 ELANEP08246 267 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 MFAP4P55083 255 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 RAB2AP61019 212 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF90Q03938 601 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 OR5B12Q96R08 314 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 TXN2Q99757 166 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 VSIRQ9H7M9 311 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-211ENST00000429899 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 GPR183P32249 361 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ADMP35318 185 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 NPBWR1P48145 328 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 RAB5CP51148 216 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 RAB9AP51151 201 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 SLURP1P55000 103 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 B2MP61769 119 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 SELENOTP62341 195 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 RAB31Q13636 194 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF726P1Q15940 193 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 TIGITQ495A1 244 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 CLLU1Q5K131 121 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF709Q8N972 641 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 RNF141Q8WVD5 230 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 USMG5Q96IX5 58 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 TUBA4BQ9H853 241 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 RPRMQ9NS64 109 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 OR2T8A6NH00 312 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 TGOLN2O43493 480 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 GNG7O60262 68 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 TOMM40O96008 361 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 CTSGP08311 255 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 M6PRP20645 277 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 FHITP49789 147 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 PLP1P60201 277 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ATP5G2Q06055 141 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 Q56UQ5 140 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 Q6ZRG5 221 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 SSX7Q7RTT5 188 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 A0A0G2JLM5 398 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 OR2C1O95371 312 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 TRBV12-3P01733 135 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms