RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP5-204ENST00000412806 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
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SH3BP5-204ENST00000412806 SCGB2A1O75556 95 aa16.8■□□□□ 0.28
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF586Q9NXT0 402 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 LY96Q9Y6Y9 160 aa16.79■□□□□ 0.28
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SH3BP5-204ENST00000412806 PEX7O00628 323 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 IGHV4-59P01825 116 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 PFN1P07737 140 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 GALR1P47211 349 aa16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP5-204ENST00000412806 SFRP2Q96HF1 295 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF98A6NK75 572 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 CLEC3BP05452 202 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 CD99P14209 185 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 GNG4P50150 75 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 CLEC19AQ6UXS0 136 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00479Q96M42 142 aa16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP5-204ENST00000412806 RPS10P46783 165 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 OR5B12Q96R08 314 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 Q9H3A6 140 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP5-204ENST00000412806 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa16.76■□□□□ 0.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 TEX38Q6PEX7 206 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 EPDR1Q9UM22 224 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 ZANQ9Y493 2812 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 PPIFP30405 207 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 IER3P46695 156 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 RAB5BP61020 215 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP5G2Q06055 141 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 CYB5R2Q6BCY4 276 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM210BQ96KR6 192 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TCEAL7Q9BRU2 100 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP1R2P9O14990 202 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV2-8P01709 118 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TRGV3P03979 118 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLC2P0DOY2 106 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 CNN1P51911 297 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 OR5I1Q13606 314 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAV34A0A0B4J273 112 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TAS2R60P59551 318 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 S100A7AQ86SG5 101 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 WFDC11Q8NEX6 87 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 OR4F17Q8NGA8 305 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 C17orf77Q96MU5 243 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 GNB4Q9HAV0 340 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa16.74■□□□□ 0.27
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