RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 H0YJW9 148 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PITX3O75364 302 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RTL8BQ17RB0 113 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZRM9 215 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CACNG5Q9UF02 275 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 A0A0G2JLM5 398 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 LY6LH3BQJ8 138 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 NXPH3O95157 252 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 APOA2P02652 100 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TCF24Q7RTU0 167 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 C1orf159Q96HA4 380 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 VAX2Q9UIW0 290 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ERG28Q9UKR5 140 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 A0A096LNT2 108 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CD99P14209 185 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ERVK-16P61578 105 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RHOBP62745 196 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MIDNQ504T8 468 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 B4DEV8 164 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ORM1P02763 201 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SPATA45Q537H7 98 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TTC32Q5I0X7 151 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PDPNQ86YL7 162 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RNF222A6NCQ9 220 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1-16P04430 117 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OR9G9P0C7N8 305 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 HTR1DP28221 377 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PAX8Q06710 450 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 C3orf56Q8N813 242 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RPEQ96AT9 228 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GW64 132 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PRD5 423 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PRF3 423 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PRM7 423 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SSSCA1O60232 199 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 HRASP01112 189 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RPL12P30050 165 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 KRTDAPP60985 99 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 DPM3Q9P2X0 92 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 NSG2Q9Y328 171 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 LRRK2Q5S007 2527 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MSMBP08118 114 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 UBE2E1P51965 193 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 B4DSR2 109 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 HKR1P10072 659 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 P2RY1P47900 373 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 GNG4P50150 75 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PSG9Q00887 426 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MOB3BQ86TA1 216 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 GPR82Q96P67 336 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 AQP10Q96PS8 301 aa4.86□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PPI3 338 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MSGN1A6NI15 193 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CHST1O43916 411 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PRH1P02810 166 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RELBQ01201 579 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.85□□□□□ -1.63
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