RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa18.31■□□□□ 0.52
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PTPRM-201ENST00000332175 C5orf64Q2M2E5 130 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 STAG3L3P0CL85 134 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf30Q96GV9 206 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 DERL1Q9BUN8 251 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 SH2D1AO60880 128 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 IFI27L1Q96BM0 104 aa18.3■□□□□ 0.52
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PTPRM-201ENST00000332175 GAS1P54826 345 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 LINC01356Q8N9X3 169 aa18.29■□□□□ 0.52
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PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H2BKO60814 126 aa18.26■□□□□ 0.51
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PTPRM-201ENST00000332175 E7EQL1 145 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRM-201ENST00000332175 PCP4P48539 62 aa18.25■□□□□ 0.51
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PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WWL8 130 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTPRM-201ENST00000332175 INSP01308 110 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTPRM-201ENST00000332175 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRM-201ENST00000332175 TEX43Q6ZNM6 134 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf139Q6ZV77 190 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRM-201ENST00000332175 RNF5Q99942 180 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRM-201ENST00000332175 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRM-201ENST00000332175 CSTL1Q9H114 145 aa18.22■□□□□ 0.51
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