RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 SRYQ05066 204 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF627Q7L945 461 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM230Q96A57 120 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 DPH3Q96FX2 82 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 FBXL15Q9H469 300 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 TAS2R45P59539 299 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 PLGLB1Q02325 96 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 CD164Q04900 197 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 AMTNQ6UX39 209 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 FAM57BQ71RH2 274 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 GJC3Q8NFK1 279 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 Q96MF0 132 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 MPC1Q9Y5U8 109 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SPTBN2O15020 2390 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 HCFC1P51610 2035 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 LY6LH3BQJ8 138 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 J3QQQ9 107 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 FGF6P10767 208 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 EFNB2P52799 333 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF90Q03938 601 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 OR1C1Q15619 314 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 OR9G1Q8NH87 305 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00479Q96M42 142 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 C18orf15Q96N68 181 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SCGB3A2Q96PL1 93 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SRXN1Q9BYN0 137 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ZMAT4Q9H898 229 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 DEPPQ9NTK1 212 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 MED13Q9UHV7 2174 aa4.02□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 C5orf49A4QMS7 147 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 LMX1BO60663 402 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 APCSP02743 223 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SSX8Q7RTT4 187 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 AAED1Q7RTV5 226 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 TEN1Q86WV5 123 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 STPG3Q8N7X2 389 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SUMF1Q8NBK3 374 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB124Q8NES8 71 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 PRRG4Q9BZD6 226 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SNURFLB1AK76 121 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM258P61165 79 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 DMRTC1Q5HYR2 192 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SPTSSAQ969W0 71 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 HES7Q9BYE0 225 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 LOC400499M0QZD8 3231 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 PINLYPA6NC86 204 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 OVOL1O14753 267 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV3-9P01782 118 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 PFN2P35080 140 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 C10orf128Q5T292 105 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 C1orf159Q96HA4 380 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SPACA5Q96QH8 159 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 GNG12Q9UBI6 72 aa4.01□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SHISA9B4DS77 424 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 M0R135 149 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 CRYGAP11844 174 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 MPV17P39210 176 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 LEPP41159 167 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 MAGEA5P43359 124 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 GGNQ86UU5 652 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF799Q96GE5 643 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 OR10A2Q9H208 303 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 VSIRQ9H7M9 311 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 SVILO95425 2214 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 A1L4Q6 167 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 DPM2O94777 84 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 CSN1S1P47710 185 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 CD69Q07108 199 aa4□□□□□ -1.77
CLVS1-201ENST00000325897 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms