RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 AP1S3Q96PC3 154 aa8.26□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 MED13LQ71F56 2210 aa8.26□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 SRIP30626 198 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 TCTAP57738 103 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00479Q96M42 142 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 ATG101Q9BSB4 218 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 RAB9AP51151 201 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 ELOBQ15370 118 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 SMUG1Q53HV7 270 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 DDB2Q92466 427 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 TCF24Q7RTU0 167 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 PSMB11A5LHX3 300 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 CXCL1P09341 107 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1W2PRE2 83 aa8.25□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 Q8N7P7 452 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 A0A087WWC5 75 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 GZMBP10144 247 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF98A6NK75 572 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 VAMP8Q9BV40 100 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1B0GW64 132 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 GCGP01275 180 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 CD33P20138 364 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 E7EUB6 86 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 TOMM40O96008 361 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 PF4P02776 101 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 OR5AL1P0C617 328 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 RNF224P0DH78 156 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 IQCJQ1A5X6 159 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 PTPRBP23467 1997 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 REV3LO60673 3130 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 HIGD1CA8MV81 97 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 GPR82Q96P67 336 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 CD99P14209 185 aa8.23□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 COX19Q49B96 90 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 DTX2Q86UW9 622 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 PSG8Q9UQ74 426 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 TEX38Q6PEX7 206 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 Q8TAT8 98 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 PROP1O75360 226 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 CR1LQ2VPA4 569 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 TBX15Q96SF7 602 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 CKS2P33552 79 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 TAS2R60P59551 318 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 LINC01551Q86U37 167 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV2-23P01705 113 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 HLA-DQA1P01909 254 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.22□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.21□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 POU2AF1Q16633 256 aa8.21□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.21□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.21□□□□□ -1.09
TTPAL-201ENST00000262605 HBBP68871 147 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 RNF182Q8N6D2 247 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 ADMP35318 185 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 COLCA2A8K830 154 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 FNDC10F2Z333 226 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.21□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 M0R381 172 aa8.2□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 IGHV4-59P01825 116 aa8.2□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms