RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 DEFB123Q8N688 67 aa17.08■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 URB1O60287 2271 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 DLL1O00548 723 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 SMIM13P0DJ93 91 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 FMC1Q96HJ9 113 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 TTTY12Q9BZ98 90 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 K7ERJ3 54 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 OVOL3O00110 214 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 NKX2-8O15522 239 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 CACNG8Q8WXS5 425 aa17.07■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 PCNX2A6NKB5 2137 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 LYZL6O75951 148 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 ORM2P19652 201 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 SCGB2A2Q13296 93 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 LGALS9BQ3B8N2 356 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 LGALS9CQ6DKI2 356 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 NPIPB6E9PJ23 425 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 GCSHP23434 173 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 FXYD2P54710 66 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 OR5AN1Q8NGI8 311 aa17.06■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 CR1LQ2VPA4 569 aa17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 RPRMLQ8N4K4 120 aa17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 FAM222BQ8WU58 562 aa17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 VGLL1Q99990 258 aa17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 TCRAP04437 139 aa17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 CKS1BP61024 79 aa17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 C17orf58Q2M2W7 97 aa17.05■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 A0A1B0GUT8 65 aa17.04■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 E7EUB6 86 aa17.04■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 ZNRD1Q9P1U0 126 aa17.04■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa17.04■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 CFHR2P36980 270 aa17.04■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 WFDC2Q14508 124 aa17.04■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 TTC28Q96AY4 2481 aa17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 PCSK5Q92824 1860 aa17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 SAP25Q8TEE9 199 aa17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 NAV3Q8IVL0 2385 aa17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 ABHD17BQ5VST6 288 aa17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 CT45A6P0DMU7 189 aa17.02■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 CT45A5P0DMU8 189 aa17.02■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 CT45A7P0DMV0 189 aa17.02■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 RND1Q92730 232 aa17.02■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 Q9H3A6 140 aa17.02■□□□□ 0.32
ODC1-201ENST00000234111 hADV38S2A0JD32 116 aa17.02■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 ERHP84090 104 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 Q86TA4 180 aa17.02■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R35Q8TAP8 253 aa17.02■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 ZNF414Q96IQ9 312 aa17.02■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 SPATA25Q9BR10 227 aa17.02■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa17.02■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 IGHV1-2P23083 117 aa17.01■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 FOXI2Q6ZQN5 318 aa17.01■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 TPPP3Q9BW30 176 aa17.01■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa17.01■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 PRNTQ86SH4 94 aa17.01■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 ASCL2Q99929 193 aa17.01■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 TTTY13Q9BZ97 58 aa17.01■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 C22orf46C9J442 243 aa17■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 CGB3P0DN86 165 aa17■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 CGB7P0DN87 165 aa17■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 SH2D6Q7Z4S9 175 aa17■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 STXBP6Q8NFX7 210 aa17■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 K7EMI3 77 aa17■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 CRYBA4P53673 196 aa17■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 RIGQ13278 110 aa17■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 SRRM5B3KS81 715 aa16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 DKK2Q9UBU2 259 aa16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 D6R8Y8 96 aa16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 J3QR89 54 aa16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 C10orf55Q5SWW7 151 aa16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 WFDC3Q8IUB2 231 aa16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 ARPC1AQ92747 370 aa16.99■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 WT1-ASQ06250 92 aa16.98■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa16.98■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 ETDBQ3ZM63 59 aa16.98■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 GCSAMQ8N6F7 178 aa16.98■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
ODC1-201ENST00000234111 ZNF785A8K8V0 405 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6 ms