RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.46□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.051e-7■■□□□ 13.2
TTL-201ENST00000233336 BMPERQ8N8U9 685 aa8.46□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 A0A1B0GUS0 222 aa8.46□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.46□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 RNF182Q8N6D2 247 aa8.46□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.46□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PPBPP02775 128 aa8.46□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.46□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 NUP35Q8NFH5 326 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 C2orf82Q6UX34 121 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGKV1D-12P01611 117 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 TFF1P04155 84 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 PLNP26678 52 aa8.46□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 CNTFRP26992 372 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 GGTLC3B5MD39 225 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 PRCDQ00LT1 54 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 FGF11Q92914 225 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 PTPN13Q12923 2485 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 CDKN1BP46527 198 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 ARPC1AQ92747 370 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGKV1-5P01602 117 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGKV1D-33P01593 117 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGKV1-33P01594 117 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 NKX2-8O15522 239 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 LHX2P50458 406 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 TDGF1P13385 188 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.45□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 M0R2P5 195 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 CD69Q07108 199 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 LAGE3Q14657 143 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RAX2Q96IS3 184 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 STPG1Q5TH74 334 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 PSG8Q9UQ74 426 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RNF125Q96EQ8 232 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 K7EP13 123 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 TRGV3P03979 118 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IFITM1P13164 125 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 D6R8Y8 96 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 LY6EQ16553 131 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.44□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 NCR2O95944 276 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RNF144BQ7Z419 303 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 DUX5Q96PT3 197 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 C9orf172C9J069 976 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 SELLP14151 372 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGHV2-5P01817 119 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGHV1-2P23083 117 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 F2Z2F3 143 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.43□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.42□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 CRYGSP22914 178 aa8.42□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.42□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 NPC2P61916 151 aa8.42□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.42□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.42□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 PAX1P15863 534 aa8.42□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TTL-201ENST00000233336 C9orf118A6NHY6 69 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms