RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFS5	O43920	106 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SFT2D2	O95562	160 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV12-3	P01733	135 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PRB1	P04280	392 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	APLNR	P35414	380 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IGFBP7	Q16270	282 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	AVPI1	Q5T686	147 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	COMMD7	Q86VX2	200 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8N377	158 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GTSF1	Q8WW33	167 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	NMES1	Q9C002	83 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF702P	Q9H963	129 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GNB4	Q9HAV0	340 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	AK3	Q9UIJ7	227 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616		J3QKU1	62 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TCAP	O15273	167 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PDCD6	O75340	191 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1D-12	P01611	117 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF728	P0DKX0	622 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	M6PR	P20645	277 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LGALS7	P47929	136 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PAX8	Q06710	450 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	BAMBI	Q13145	260 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDX4	Q13162	271 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF345	Q14585	488 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RPRML	Q8N4K4	120 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	NEK7	Q8TDX7	302 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf50	Q96LR7	162 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	VSIR	Q9H7M9	311 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MED9	Q9NWA0	146 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PSG8	Q9UQ74	426 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CD300LB	A8K4G0	201 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616		I3L521	148 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PEX7	O00628	323 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL2L11	O43521	198 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNA21	P01568	189 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	NMB	P08949	121 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	HBG1	P69891	147 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	HBG2	P69892	147 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TFF3	Q07654	80 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	HERPUD1	Q15011	391 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PIGY	Q3MUY2	71 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM12	Q96EX1	92 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXL15	Q9H469	300 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		3.61	□□□□□ -1.83

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