RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF580Q9UK33 172 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD2BA6NFX1 497 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB5BO43169 146 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL29P47914 159 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A13Q7RTY0 426 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-216ENST00000628306 OR11H1Q8NG94 326 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35E1Q96K37 410 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-216ENST00000628306 GNB4Q9HAV0 340 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-216ENST00000628306 I3L521 148 aa18.52■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 IGF1P05019 195 aa18.52■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM41BQ5BJD5 291 aa18.52■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 MBD3L1Q8WWY6 194 aa18.52■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK15Q9H2R5 256 aa18.52■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SMCO3A2RU48 225 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 MFAP2P55001 183 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 UQCC3Q6UW78 93 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM116Q8NCL8 245 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD5Q8WTS1 349 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 MGST2Q99735 147 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RPRMQ9NS64 109 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RFNGQ9Y644 331 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TNCP24821 2201 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 LCE6AA0A183 80 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIFP30405 207 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 AKR1C1Q04828 323 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP8Q8NA92 274 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 LFNGQ8NES3 379 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM213BQ8TBF2 198 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 GGTLC1Q9BX51 225 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX46H3BTG2 121 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 AGPAT2O15120 278 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 HBE1P02100 147 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 REG1AP05451 166 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 H2AFB1P0C5Y9 115 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 M6PRP20645 277 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 INSL3P51460 131 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 AKIRIN2Q53H80 203 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC45A2Q9UMX9 530 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FHITP49789 147 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB2AP61019 212 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR20EP86478 221 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR20CP86479 221 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR20DP86480 221 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR20BP86481 221 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR20AP86496 221 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 NDPQ00604 133 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PMS2P11Q13670 270 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 MLANAQ16655 118 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF491Q8N8L2 437 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 HRH4Q9H3N8 390 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 I3L2K1 104 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFA4P12838 97 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FFAR4Q5NUL3 377 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSM6Q6P461 480 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2E2Q96LR5 201 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 THYN1Q9P016 225 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 DMRT1Q9Y5R6 373 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SELENOTP62341 195 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF616Q08AN1 781 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1N2Q8NGR9 330 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 G3V318 75 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 BRI3O95415 125 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV1-40P01703 118 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10G4Q8NGN3 311 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10G9Q8NGN4 311 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10G7Q8NGN6 311 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4X1Q8NH49 305 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 MISP3Q96FF7 219 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CITED4Q96RK1 184 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PXMP4Q9Y6I8 212 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 MT-CO2P00403 227 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00869P0C866 280 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SPSB3Q6PJ21 355 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPB3Q92617 1050 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 FANCD2OSQ96PS1 177 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 TRGV9Q99603 122 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SMDT1Q9H4I9 107 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 VSIRQ9H7M9 311 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A9Q9NUM3 307 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 B2MP61769 119 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5B12Q96R08 314 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 K7EIM0 57 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 YIF1AO95070 293 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10J1P30954 320 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ELLP55199 621 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SFT2D1Q8WV19 159 aa18.42■□□□□ 0.54
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