RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DUX3Q96PT4 197 aa3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PARP11Q9NR21 331 aa3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TNCP24821 2201 aa3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ODAMA1E959 279 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UMAD1C9J7I0 102 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 K7ERU9 68 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MGST3O14880 152 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PDE6DO43924 150 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HBZP02008 142 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GYPAP02724 150 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C8orf88P0DMB2 117 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PSG2P11465 335 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GABRA2P47869 451 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SULT1A2P50226 295 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AKR1C2P52895 323 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TAS2R30P59541 319 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ERVFRD-1P60508 538 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BLCAPP62952 87 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CATR1Q13166 79 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MLANAQ16655 118 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM219Q86XT9 240 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DRAM1Q8N682 238 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR8U1Q8NH10 309 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR52E5Q8NH55 327 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR51H1Q8NH63 302 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR4S2Q8NH73 311 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR1L1Q8NH94 360 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ISOC2Q96AB3 205 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LINC00052Q96N35 136 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GINS3Q9BRX5 216 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 JPT1Q9UK76 154 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGSF23A1L1A6 192 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM218A2RU14 115 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LRRC30A6NM36 301 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C15orf65H3BRN8 121 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 K7N7A8 449 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC17A3O00476 420 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DVL1O14640 695 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CHEK1O14757 476 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TNFSF12O43508 249 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SSSCA1O60232 199 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 S1PR2O95136 353 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGKV1-39P01597 117 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGKV1-5P01602 117 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGKV1D-39P04432 117 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NPSP0C0P6 89 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OR8U8P0C7N1 319 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 P0C879 139 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EDN2P20800 178 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LPAR6P43657 344 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GLIPR1P48060 266 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SULT1A1P50225 295 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BTN1A1Q13410 526 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FHL3Q13643 280 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LINC01620Q4KN68 170 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF585BQ52M93 769 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BTNL8Q6UX41 500 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 Q8N1Y9 231 aa3.15□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 Q8N2B8 174 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms