RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 EPDR1Q9UM22 224 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 TEX22C9J3V5 150 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 K7ENP7 123 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 EREGO14944 169 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 GPX1P07203 203 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 FAM87AP0C7U9 286 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 RNF224P0DH78 156 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 C22orf15Q8WYQ4 148 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 FBXL7Q9UJT9 491 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 ZZEF1O43149 2961 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PGPA6NDG6 321 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF253O75346 499 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 HYPMO75409 117 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 APCSP02743 223 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 COX7A1P24310 79 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 SLAQ13239 276 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PRR27Q6MZM9 219 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 NUP35Q8NFH5 326 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 GRAMD2BQ96HH9 432 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 SGK494Q96LW2 274 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 A0A1W2PS18 150 aa13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 SIAH2O43255 324 aa13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 GP9P14770 177 aa13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PAX2Q02962 417 aa13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 LEMD1Q68G75 181 aa13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 KCNS1Q96KK3 526 aa13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 FBXL15Q9H469 300 aa13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.87□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 CORTO00230 105 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PPIAL4GP0DN37 164 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 GRNP28799 593 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 MUC15Q8N387 334 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 VN1R17PQ8TDU5 208 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PLP1P60201 277 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 UBE2G1P62253 170 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 RASL11AQ6T310 242 aa13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 TACC2O95359 2948 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 C8orf46Q8TAG6 207 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 RPEQ96AT9 228 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 LY6LH3BQJ8 138 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 H3BTX0 84 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 RBP4P02753 201 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 AMTP48728 403 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 Q8N976 141 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 TSKUQ8WUA8 353 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM68Q96MH6 324 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 NEU1Q99519 415 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 SCNM1Q9BWG6 230 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 NRN1Q9NPD7 142 aa13.85□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.84□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 VWC2LB2RUY7 222 aa13.84□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa13.84□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 GPR82Q96P67 336 aa13.84□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 MLST8Q9BVC4 326 aa13.84□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 DCHS2Q6V1P9 2916 aa13.84□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 LRBAP50851 2863 aa13.84□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 IGLC1P0CG04 106 aa13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PSG1P11464 419 aa13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 PMCHP20382 165 aa13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 KRTDAPP60985 99 aa13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 ATG101Q9BSB4 218 aa13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF586Q9NXT0 402 aa13.83□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 HIGD1CA8MV81 97 aa13.83□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 I3L2K1 104 aa13.83□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 SMIM12Q96EX1 92 aa13.83□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 CHRDL1Q9BU40 450 aa13.83□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 Q9H3A6 140 aa13.83□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.82□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 TOMM40O96008 361 aa13.82□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 TCRAP04437 139 aa13.82□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 SSTP61278 116 aa13.82□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 HIGD1AQ9Y241 93 aa13.82□□□□□ -0.2
MEIS3-211ENST00000561204 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms