RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 EHFQ9NZC4 300 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SSR3Q9UNL2 185 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0B4J293 547 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 M0QYG6 137 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 PMP2P02689 132 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ATP5G1P05496 136 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 IGLC1P0CG04 106 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ETV6P41212 452 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ATP5G3P48201 142 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 PAX9P55771 341 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC00315P59091 139 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF846Q147U1 533 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 CTF1Q16619 201 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ESRGQ1W209 222 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF503Q96F45 646 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 UPK3BQ9BT76 320 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 CBY3A6NI87 242 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM229AH3BQW9 127 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SOCS3O14543 225 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SCGB2A1O75556 95 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 IL4P05112 153 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 AZU1P20160 251 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 CBX5P45973 191 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ICAM4Q14773 271 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 BSXQ3C1V8 233 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 Q6ZSN1 163 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC35G3Q8N808 338 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 KLK11Q9UBX7 282 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0J9YX75 114 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 A8MTW9 85 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 NXPH3O95157 252 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 IGKV1-5P01602 117 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 P0C879 139 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ELK1P19419 428 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10J1P30954 320 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 ID1P41134 155 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 PSMB3P49720 205 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 RND2P52198 227 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 HAMPP81172 84 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 AMTNQ6UX39 209 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTA-217ENST00000560521 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.15□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0A6YYH2 397 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 A6NJ64 397 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 EREGO14944 169 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TOMM40O96008 361 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 IFNA5P01569 189 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TSPOP30536 169 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TAS2R20P59543 309 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 MZT2AQ6P582 158 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 COQ8AQ8NI60 647 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 GPR146Q96CH1 333 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 C20orf173Q96LM9 149 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 ABHD1Q96SE0 405 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 CCDC32Q9BV29 185 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 IFT46Q9NQC8 304 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 DIABLOQ9NR28 239 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 RD3LP0DJH9 198 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 PSG1P11464 419 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 NAT1P18440 290 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SCAND1P57086 179 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 DEFA1P59665 94 aa6.13□□□□□ -1.43
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