RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559758.5

ETFA-209, Transcript of electron transfer flavoprotein subunit alpha, human

TSL 2

Gene ETFA, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETFA-209	ENST00000559758	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	NMES1	Q9C002	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758		H7C2Y5	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	NBR2	O15453	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	BCL2L11	O43521	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PPY	P01298	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PMP2	P02689	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	IGF1	P05019	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	NMB	P08949	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PSMB6	P28072	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	HRH1	P35367	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PSG5	Q15238	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	MMD	Q15546	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	CRYGB	P07316	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	AKR1C4	P17516	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ZP3	P21754	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	GNRHR	P30968	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	FCN1	O00602	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	CNTFR	P26992	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	UBE2K	P61086	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	CTAG1A	P78358	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	SLC35B1	P78383	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	CATR1	Q13166	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758		Q8N377	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	STPG2	Q8N412	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETFA-209	ENST00000559758	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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