RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	IGHG2	P01859	326 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	CHRNA7	P36544	502 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	HERV-K104	P61576	105 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	VAMP2	P63027	116 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	LRTM2	Q8N967	370 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573		S4R3C0	116 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	S1PR2	O95136	353 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	DIRAS3	O95661	229 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	APOA2	P02652	100 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	REG1A	P05451	166 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	IMMP2L	Q96T52	175 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	C20orf202	A1L168	122 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	IGHV3-11	P01762	117 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	CTXN2	P0C2S0	81 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	P2RX4	Q99571	388 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	NDUFA3	O95167	84 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	CNIH1	O95406	144 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	KRAS	P01116	189 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	G6PC	P35575	357 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	RAB11A	P62491	216 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM187	Q14656	261 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	TNXA	Q16473	311 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	SPINK9	Q5DT21	86 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	NPB	Q8NG41	125 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	MOB3A	Q96BX8	217 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
FAM227B-208	ENST00000559573	MC5R	P33032	325 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	FXYD3	Q14802	87 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	NXPH3	O95157	252 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	TYMS	P04818	313 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	PF4V1	P10720	104 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	THBS3	P49746	956 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	RTL8B	Q17RB0	113 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF585B	Q52M93	769 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	PDPN	Q86YL7	162 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	OR2C3	Q8N628	320 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	TP53RK	Q96S44	253 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	NAA60	Q9H7X0	242 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	RFNG	Q9Y644	331 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV1-39	P01597	117 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV1D-39	P04432	117 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	CRYGB	P07316	175 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC35E1	Q96K37	410 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	RBKS	Q9H477	322 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	GNB4	Q9HAV0	340 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	NAT8	Q9UHE5	227 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GUS0	222 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573		G3V4G9	280 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	IGHV3-23	P01764	117 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	HLA-DRB1	P01911	266 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	PPBP	P02775	128 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	BCL2	P10415	239 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	GALR1	P47211	349 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	PTTG1IP	P53801	180 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	PIGP	P57054	158 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	TREML4	Q6UXN2	200 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FAM227B-208	ENST00000559573	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		7.88	□□□□□ -1.15

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