RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ARV1Q9H2C2 271 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 S4R3C0 116 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 SMCO3A2RU48 225 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 IFNA5P01569 189 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ELANEP08246 267 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 FGF7P21781 194 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 RAB9AP51151 201 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 AKR1C1Q04828 323 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ACSM6Q6P461 480 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 TEX38Q6PEX7 206 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 SLC51BQ86UW2 128 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 RNF152Q8N8N0 203 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 THAP8Q8NA92 274 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 OR4F5Q8NH21 305 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 OR4X1Q8NH49 305 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 NPIPB3Q92617 1050 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ACY3Q96HD9 319 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 USMG5Q96IX5 58 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 CXorf58Q96LI9 332 aa6.22□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 GINS3Q9BRX5 216 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 MPDU1O75352 247 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 CLN5O75503 358 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 IGHV3-23P01764 117 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 ATP6V0CP27449 155 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 MFAP4P55083 255 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 RUNX1Q01196 453 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 ATP5G2Q06055 141 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 BTNL8Q6UX41 500 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 COMMD1Q8N668 190 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 RAX2Q96IS3 184 aa6.21□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 MGST2Q99735 147 aa6.21□□□□□ -1.42
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BEST3-211ENST00000552295 IGLC1P0CG04 106 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 SPP1P10451 314 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 OR10J1P30954 320 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 NPBWR1P48145 328 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 PROK1P58294 105 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 Q56UQ5 140 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 BAP18Q8IXM2 172 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 ATP6V0BQ99437 205 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 TRGV9Q99603 122 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.2□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.2□□□□□ -1.42
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BEST3-211ENST00000552295 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 OR2T8A6NH00 312 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 ZFP92A6NM28 416 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 TRBV12-3P01733 135 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 IGHV3-11P01762 117 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 CTSGP08311 255 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 GPR183P32249 361 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 CAMLGP49069 296 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 IFITM2Q01629 132 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 ZNF90Q03938 601 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 TIGITQ495A1 244 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.19□□□□□ -1.42
BEST3-211ENST00000552295 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.19□□□□□ -1.42
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