RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2WQ96B02 151 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CKS2P33552 79 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MPV17P39210 176 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FAM27E3Q08E93 113 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 WDR38Q5JTN6 314 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LRTM2Q8N967 370 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DDB2Q92466 427 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM243Q9BU79 118 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PCM1Q15154 2024 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 HRKO00198 91 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SOCS1O15524 211 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ACYP1P07311 99 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SCTP09683 121 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PI3P19957 117 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LOXL3P58215 753 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DAD1P61803 113 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 VSIG4Q9Y279 399 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 UNC119Q13432 240 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DPM3Q9P2X0 92 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SEC16AO15027 2179 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GX51 115 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 A8MWL6 223 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LYL1P12980 280 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DRAM1Q8N682 238 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 H7C2G1 150 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 BUB3O43684 328 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFB8O95169 186 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FGF12P61328 243 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DTX1Q86Y01 620 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf46Q8TAG6 207 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CCL13Q99616 98 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SCN5AQ14524 2016 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CECR9P0C854 216 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 NRTNQ99748 197 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 NCOR1O75376 2440 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC179H3BU77 68 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PMAIP1Q13794 54 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 METTL26Q96S19 204 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 AGMATQ9BSE5 352 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MIA3Q5JRA6 1907 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SIP14410 1827 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 COX8AP10176 69 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MYOD1P15172 320 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 GATD1Q8NB37 220 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-7P01780 117 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MT-ATP8P03928 68 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PSG7Q13046 419 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 GUSBP1Q15486 140 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LYRM9A8MSI8 78 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L23D6RBM5 183 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DNAL4O96015 105 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1D-16P01601 117 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PATE4P0C8F1 98 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf82Q6UX34 121 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ZIC3O60481 467 aa5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms