RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-23P01764 117 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 P2RY4P51582 365 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 PRR32B1ATL7 298 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 APCSP02743 223 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZWC4 215 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 GBF1Q92538 1859 aa6.55□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 OVOL3O00110 214 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF138P52744 262 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF329Q86UD4 541 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.55□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 ST20Q9HBF5 79 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB131AP59861 70 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 PRR31Q5SQ13 230 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 ISOC2Q96AB3 205 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF253O75346 499 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 CNTFRP26992 372 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 SPATA25Q9BR10 227 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 PROK2Q9HC23 129 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 PLXNA2O75051 1894 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 M0R143 59 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF98A6NK75 572 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 PEX7O00628 323 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 PIN1P1O15428 100 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 SS18Q15532 418 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 NOTCH2Q04721 2471 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 AQP10Q96PS8 301 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 ATP6V0E1O15342 81 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 SDK2Q58EX2 2172 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 M0R381 172 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 PSG3Q16557 428 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 C14orf177Q52M58 125 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 Q9H3A6 140 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.52□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 CD24P25063 80 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 INSL4Q14641 139 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZNX1 250 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 RNF138Q8WVD3 245 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 Q6P435 159 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 M0R2Z0 102 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 PSMB2P49721 201 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 CD8AP01732 235 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GUT8 65 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 CLLU1Q5K131 121 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.51□□□□□ -1.37
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