RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A16P16260 332 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H2BOP23527 126 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CRYBB3P26998 211 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H2BBP33778 126 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H2BDP58876 126 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H2BCP62807 126 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST2H2BEQ16778 126 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 DEFB113Q30KQ7 82 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00305Q7Z4B0 112 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H2BHQ93079 126 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 IMMP2LQ96T52 175 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H2BNQ99877 126 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H2BMQ99879 126 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CR1P17927 2039 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PPQ1 181 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 GGTLC3B5MD39 225 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 GGCTO75223 188 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ORM2P19652 201 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 FXYD3Q14802 87 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 C5orf64Q2M2E5 130 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 OR51M1Q9H341 326 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 S100A8P05109 93 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 NDUFA6P56556 154 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 STXBP6Q8NFX7 210 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 OR1L6Q8NGR2 347 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 OR1B1Q8NGR6 318 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 I3L2K1 104 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 FRZBQ92765 325 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HYPMO75409 117 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HNF1AP20823 631 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX38Q6PEX7 206 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 OR10G8Q8NGN5 311 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 BTF3L4Q96K17 158 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 MSMBP08118 114 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TRGC1P0CF51 173 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PYYP10082 97 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXA5P20719 270 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 GNG4P50150 75 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF98A6NK75 572 aa16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PHOX2AO14813 284 aa16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PLP1P60201 277 aa16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXL1Q12952 345 aa16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 C12orf57Q99622 126 aa16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TCEAL7Q9BRU2 100 aa16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SAA4P35542 130 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MEOX2P50222 304 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 EBI3Q14213 229 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPWQ5EE01 88 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF562Q6V9R5 426 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FXYD5Q96DB9 178 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCA1O95477 2261 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 K7EN84 100 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TYMSP04818 313 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 IGLC1P0CG04 106 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 Q8N6K4 173 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ITPR2Q14571 2701 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PDZD2O15018 2839 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SGMS2Q8NHU3 365 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 RASL11BQ9BPW5 248 aa16■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 B4DSR2 109 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 NPFFO15130 113 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TIGITQ495A1 244 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CSPG4Q6UVK1 2322 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 K7EIM0 57 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 S100A9P06702 114 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FABP1P07148 127 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PSG1P11464 419 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM11P17152 192 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CX3CL1P78423 397 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 Q5PR19 223 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ARPC1AQ92747 370 aa15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF223E7ERA6 249 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM106CPP0CH98 169 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MBD6Q96DN6 1003 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 HIGD1AQ9Y241 93 aa15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FASNP49327 2511 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 NPIPB5A8MRT5 1133 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 AVPP01185 164 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM120AOSQ5T036 256 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF329Q86UD4 541 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAV40A0A0B4J280 105 aa15.97■□□□□ 0.15
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms