RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa16.41■□□□□ 0.22
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PTPRK-222ENST00000532751 RPL11P62913 178 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRK-222ENST00000532751 AKR1C1Q04828 323 aa16.41■□□□□ 0.22
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PTPRK-222ENST00000532751 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa16.41■□□□□ 0.22
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PTPRK-222ENST00000532751 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 MAP6D1Q9H9H5 199 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 FAM24AA6NFZ4 105 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 DEDDO75618 318 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 TEPPQ6URK8 271 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa16.31■□□□□ 0.2
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PTPRK-222ENST00000532751 FBXL17Q9UF56 701 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 K7EQG2 157 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 SELENOTP62341 195 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 SLC38A11Q08AI6 406 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 ARL16Q0P5N6 197 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 STX12Q86Y82 276 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 APRG1Q8IVJ8 170 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRK-222ENST00000532751 SLC45A2Q9UMX9 530 aa16.3■□□□□ 0.2
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