RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495426.1

BBS9-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 3

Gene BBS9, Length 481 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-213	ENST00000495426	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM50A	O95807	157 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	HLA-DRB4	P13762	266 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	CRYBB3	P26998	211 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	TNFSF8	P32971	234 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SPINK9	Q5DT21	86 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	OR4A16	Q8NH70	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	ATG101	Q9BSB4	218 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	RFNG	Q9Y644	331 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426		H3BMM0	161 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	GPR31	O00270	319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	CLN5	O75503	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SCGB2A1	O75556	95 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	FXYD7	P58549	80 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	OXA1L	Q15070	435 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SLC35G3	Q8N808	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SEC22A	Q96IW7	307 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	IFT46	Q9NQC8	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	CORT	O00230	105 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	IGKV3-20	P01619	116 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SNCA	P37840	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	OPRK1	P41145	380 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	CBX5	P45973	191 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	AQP4	P55087	323 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	DAD1	P61803	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM230	Q96A57	120 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	NRN1	Q9NPD7	142 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426		A0A0A6YYH2	397 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426		A6NJ64	397 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	IGKV1-39	P01597	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	IGKV1-17	P01599	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	HBE1	P02100	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	PMP2	P02689	132 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	IGKV1D-39	P04432	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	RFX2	P48378	723 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	DEFB1	P60022	68 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	OR4X1	Q8NH49	305 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	S100G	P29377	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	TAS2R46	P59540	309 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	MXD1	Q05195	221 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF709	Q8N972	641 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	DIABLO	Q9NR28	239 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BBS9-213	ENST00000495426	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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