RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 GDPD1Q8N9F7 314 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 BTF3L4Q96K17 158 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 HFM1A2PYH4 1435 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3C2GO75747 1445 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 AKR1C3P42330 323 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 KRT222Q8N1A0 295 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 OR8B3Q8NGG8 313 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 MBD3L1Q8WWY6 194 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM106AQ96A25 262 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ITSN1Q15811 1721 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 TIAM2Q8IVF5 1701 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ATP7BP35670 1465 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 KNDC1Q76NI1 1749 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 PDE6DO43924 150 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5HO75947 161 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 OOSP2Q86WS3 158 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 DHFR2Q86XF0 187 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 BAIAP2Q9UQB8 552 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 CENPFP49454 3210 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-212ENST00000491302 TTC28Q96AY4 2481 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC144AA2RUR9 1427 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 DEFA1P59665 94 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ELOBQ15370 118 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 MOGQ16653 247 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CKLFQ9UBR5 152 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 SCN11AQ9UI33 1791 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 LAMA3Q16787 3333 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 SORL1Q92673 2214 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 GPX2P18283 190 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 HOXA6P31267 233 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 RUNX1Q01196 453 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 TMED2Q15363 201 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 KISS1Q15726 138 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM5Q71RC9 77 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 MIR17HGQ75NE6 70 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 OR51A2Q8NGJ7 313 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 GINS4Q9BRT9 223 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 KIFC1Q9BW19 673 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 RTL1A6NKG5 1358 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CR1P17927 2039 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 TTC21AQ8NDW8 1320 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 MAST4O15021 2626 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CLTCL1P53675 1640 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP11Q9UKA4 1901 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 G6PCP35575 357 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 AAED1Q7RTV5 226 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 SIGMAR1Q99720 223 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 C14orf105Q9NVL8 296 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ROBO3Q96MS0 1386 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 FASNP49327 2511 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF462Q96JM2 2506 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP12Q02952 1782 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 TNS3Q68CZ2 1445 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 BDP1A6H8Y1 2624 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CEP290O15078 2479 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC18Q5T9S5 1454 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 KIF24Q5T7B8 1368 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 PMP2P02689 132 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINE1P05121 402 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 HSD11B1P28845 292 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf74Q32Q52 190 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 LIN52Q52LA3 116 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 FAM173BQ6P4H8 233 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 TERB2Q8NHR7 220 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 PFN4Q8NHR9 129 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF563Q8TA94 476 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC9Q8WXX5 260 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP54Q96N23 3096 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CEP152O94986 1710 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
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