RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491160.1

PBX3-208, Transcript of PBX homeobox 3, human

TSL 5

Gene PBX3, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PBX3-208	ENST00000491160	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	DDB2	Q92466	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160		H7C2Y5	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	MOS	P00540	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	IFNA17	P01571	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160		P0C879	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	NQO2	P16083	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	FGF7	P21781	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	CNTFR	P26992	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	RITA1	Q96K30	269 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PBX3-208	ENST00000491160	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160		C9JQL5	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160		H3BS24	57 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SLC31A2	O15432	143 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	BRI3	O95415	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MB	P02144	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CD1B	P29016	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CEBPG	P53567	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SPCS3	P61009	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RAB11A	P62491	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CTAG1A	P78358	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SERF2	P84101	59 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RHEB	Q15382	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MLX	Q9UH92	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160		A0A1W2PN81	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SOX15	O60248	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HRAS	P01112	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	IFNA10	P01566	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	APOA2	P02652	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	BCL2	P10415	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CHRNA7	P36544	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RAB5B	P61020	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ICAM4	Q14773	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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