RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NME4-210ENST00000468031 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.84□□□□□ -0.03
NME4-210ENST00000468031 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 NDUFA6P56556 154 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 TIGITQ495A1 244 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 AKAP6Q13023 2319 aa14.83□□□□□ -0.04
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NME4-210ENST00000468031 HNF1AP20823 631 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 SAA4P35542 130 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 NDPQ00604 133 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 FAM168AQ92567 244 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 HLA-DRB1P01911 266 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 MEOX2P50222 304 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.82□□□□□ -0.04
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NME4-210ENST00000468031 RD3LP0DJH9 198 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 LYZP61626 148 aa14.81□□□□□ -0.04
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NME4-210ENST00000468031 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 Q8N9W7 124 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 C12orf57Q99622 126 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 IL36BQ9NZH7 164 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.81□□□□□ -0.04
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NME4-210ENST00000468031 IGLV2-8P01709 118 aa14.8□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.8□□□□□ -0.04
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NME4-210ENST00000468031 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.8□□□□□ -0.04
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NME4-210ENST00000468031 MED13LQ71F56 2210 aa14.8□□□□□ -0.04
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NME4-210ENST00000468031 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.8□□□□□ -0.04
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NME4-210ENST00000468031 ISLRO14498 428 aa14.79□□□□□ -0.04
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NME4-210ENST00000468031 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 RNF224P0DH78 156 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 RANP62826 216 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 OR5I1Q13606 314 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 EPDR1Q9UM22 224 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
NME4-210ENST00000468031 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 KLK9Q2XQG4 91 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 GNG7O60262 68 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 ATP5J2P56134 94 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 BLNKQ8WV28 456 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 RNF125Q96EQ8 232 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 SMIM12Q96EX1 92 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 TMEM68Q96MH6 324 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 H3BRN7 92 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 SLC17A3O00476 420 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 RPEL1Q2QD12 228 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 LEMD1Q68G75 181 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 S100A7AQ86SG5 101 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-210ENST00000468031 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.76□□□□□ -0.05
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