RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 VAMP2P63027 116 aa12.6□□□□□ -0.39
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF90Q03938 601 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-204ENST00000442563 TCF24Q7RTU0 167 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM144Q7Z5S9 345 aa12.6□□□□□ -0.39
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RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf1Q9H5F2 150 aa12.6□□□□□ -0.39
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RABGEF1-204ENST00000442563 METTL15P1P0C7V9 234 aa12.59□□□□□ -0.39
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RABGEF1-204ENST00000442563 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
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RABGEF1-204ENST00000442563 RAB32Q13637 225 aa12.58□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 NPVFQ9HCQ7 196 aa12.58□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 DEDDO75618 318 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 CCNKO75909 580 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 AKR1C1Q04828 323 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 HELTA6NFD8 242 aa12.56□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 GLMPQ8WWB7 406 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.56□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 SIX6O95475 246 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 BCAP31P51572 246 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 CAV2P51636 162 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 S100A10P60903 97 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 RPL11P62913 178 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 SLC45A2Q9UMX9 530 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 RLN2P04090 185 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 SELENOTP62341 195 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf194Q5T5A4 169 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM252Q8N6L7 170 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZMAT4Q9H898 229 aa12.54□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 S100A7P31151 101 aa12.53□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 TEPPQ6URK8 271 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 CITED4Q96RK1 184 aa12.53□□□□□ -0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 E5RGE8 158 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EQG2 157 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 S100A11P31949 105 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 SULT1A1P50225 295 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 PLP1P60201 277 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 WFDC3Q8IUB2 231 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 CST7O76096 145 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC38A11Q08AI6 406 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP6V1FQ16864 119 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-204ENST00000442563 STX12Q86Y82 276 aa12.51□□□□□ -0.41
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