RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-208ENST00000420964 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 FAM209BQ5JX69 171 aa9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 RNF141Q8WVD5 230 aa9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 OR5B12Q96R08 314 aa9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 VSIRQ9H7M9 311 aa9.53□□□□□ -0.88
FAAP20-208ENST00000420964 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 HAX1O00165 279 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 TRBV12-3P01733 135 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 RD3LP0DJH9 198 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PSG1P11464 419 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 M6PRP20645 277 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PROK1P58294 105 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 Q6ZRG5 221 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 STAB1Q9NY15 2570 aa9.52□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 A0A1B0GUS0 222 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 BMPR1BO00238 502 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 COX7A2P2O60397 106 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 CD28P10747 220 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 FHITP49789 147 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 LYZP61626 148 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 Q8WTZ3 238 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 RPRMQ9NS64 109 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 DOK5Q9P104 306 aa9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 OR2C1O95371 312 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 IL4P05112 153 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PLP1P60201 277 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 RAB14P61106 215 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 RNF125Q96EQ8 232 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PFDN5Q99471 154 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 SLC25A22Q9H936 323 aa9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 NUDT19A8MXV4 375 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 I3L521 148 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 HYPMO75409 117 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 NMBP08949 121 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 OR5G3P0C626 314 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 ORM2P19652 201 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 RHOBP62745 196 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 ZNF726P1Q15940 193 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 SSX7Q7RTT5 188 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.49□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 A0A1W2PPV4 95 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 BLOC1S1P78537 153 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 FOXL1Q12952 345 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 CLLU1Q5K131 121 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 PATE2Q6UY27 113 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 RNF2Q99496 336 aa9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
FAAP20-208ENST00000420964 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms