RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411670.5

CCDC18-AS1-201, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 675 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LINC00052Q96N35 136 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TP53RKQ96S44 253 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DEFB130BP0DP73 79 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DEFB130AP0DP74 79 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PI3P19957 117 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 OR10J1P30954 320 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TGFBR1P36897 503 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RORCP51449 518 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TAS2R46P59540 309 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RRN3P1Q2M238 152 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FAM78BQ5VT40 261 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 AMTNQ6UX39 209 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SSX7Q7RTT5 188 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 C17orf77Q96MU5 243 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DIABLOQ9NR28 239 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.53□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 A0A0J9YX75 114 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 A8MTW9 85 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 F5H768 121 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TOMM40O96008 361 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PSG1P11464 419 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 AZU1P20160 251 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ALDH3B2P48448 385 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PAX9P55771 341 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PSG9Q00887 426 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 Q8WTZ3 238 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NPIPB3Q92617 1050 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 UHRF2Q96PU4 802 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 Q9H8V8 135 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SCPEP1Q9HB40 452 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PSMB3P49720 205 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 AKR1C2P52895 323 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CCL18P55774 89 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 UCP3P55916 312 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SP6Q3SY56 376 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 AARDQ4LEZ3 155 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GPX8Q8TED1 209 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 Q9H3A6 140 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MDFICQ9P1T7 246 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KLK11Q9UBX7 282 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 A0A087WXM4 84 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LYRM9A8MSI8 78 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 M0QYG6 137 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 M0R2Z0 102 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SCGB2A1O75556 95 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RD3LP0DJH9 198 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PIGPP57054 158 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KRTAP10-1P60331 282 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RND3P61587 244 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TSPAN5P62079 268 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 C2orf83Q53S99 150 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BAP18Q8IXM2 172 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 COQ8AQ8NI60 647 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RNF125Q96EQ8 232 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ACY3Q96HD9 319 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 C18orf15Q96N68 181 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ENY2Q9NPA8 101 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TNFAIP8O95379 198 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SLC25A4P12235 298 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 S100GP29377 79 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PRSS3P35030 304 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HTR2BP41595 481 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LINC00315P59091 139 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SPCS3P61009 180 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HAMPP81172 84 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZNF90Q03938 601 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ESRGQ1W209 222 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TRIM16LQ309B1 348 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms