RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 SBF2Q86WG5 1849 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 F2Z2F3 143 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 FOXF2Q12947 444 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 SPTA1P02549 2419 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 C15orf62A8K5M9 175 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 PATE3B3GLJ2 98 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 C9JAW5 83 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 NPFFO15130 113 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 PLNP26678 52 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 ZNF114Q8NC26 417 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 CSTL1Q9H114 145 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 PRR33A8MZF0 331 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 SMKR1H3BMG3 65 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 MMP23AO75900 390 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 TCRAP04437 139 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 CD24P25063 80 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 FHL1Q13642 323 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 DDB2Q92466 427 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 ASCL2Q99929 193 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 SLAQ13239 276 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 RNF182Q8N6D2 247 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 RAX2Q96IS3 184 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 A0A0U1RRA0 63 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPM0 123 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 CFPP27918 469 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 ASCL4Q6XD76 172 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 RNF125Q96EQ8 232 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 RCHY1Q96PM5 261 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 M0R2P5 195 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 EFNA2O43921 213 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 LINC00205P59089 165 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 NPC2P61916 151 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 ATP5G2Q06055 141 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 NRN1LQ496H8 165 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 CECR9P0C854 216 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 PAX9P55771 341 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 TDRG1Q3Y452 100 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 AMN1Q8IY45 258 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 COX8AP10176 69 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 LINC01559Q495D7 138 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 LIME1Q9H400 295 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 MYOD1P15172 320 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 F8W1H4 67 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 SAP30O75446 220 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1D-33P01593 117 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1-33P01594 117 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 COL4A5P29400 1685 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 TM4SF5O14894 197 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 MLNRO43193 412 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 CCL3L1P16619 93 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 ARPC1AQ92747 370 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 NABP1Q96AH0 204 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 H7C1H1 209 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 TMPRSS3P57727 454 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 TDHQ8IZJ6 230 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-202ENST00000402738 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.06□□□□□ -1.12
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