RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 JTBO76095 146 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 APELAP0DMC3 54 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 TEX38Q6PEX7 206 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 CXorf58Q96LI9 332 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 ARL6Q9H0F7 186 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 ARV1Q9H2C2 271 aa4.6□□□□□ -1.67
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PDE4D-202ENST00000317118 FBXL17Q9UF56 701 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 A0A0G2JLM5 398 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 MPDU1O75352 247 aa4.59□□□□□ -1.67
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PDE4D-202ENST00000317118 RAB9AP51151 201 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 HERV-K104P63124 156 aa4.59□□□□□ -1.67
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PDE4D-202ENST00000317118 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 THAP8Q8NA92 274 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 OR4X1Q8NH49 305 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 LINC01006Q8NI28 216 aa4.59□□□□□ -1.67
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PDE4D-202ENST00000317118 SLC35E1Q96K37 410 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 OR51M1Q9H341 326 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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PDE4D-202ENST00000317118 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1W2PPQ1 181 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 NDUFB8O95169 186 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 C19orf35Q6ZS72 473 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 MISP3Q96FF7 219 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 WFDC1Q9HC57 220 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-202ENST00000317118 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.59□□□□□ -1.67
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PDE4D-202ENST00000317118 OR2J3O76001 311 aa4.59□□□□□ -1.68
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PDE4D-202ENST00000317118 PRH1P02810 166 aa4.59□□□□□ -1.68
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PDE4D-202ENST00000317118 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 GINS3Q9BRX5 216 aa4.59□□□□□ -1.68
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PDE4D-202ENST00000317118 S100A7P31151 101 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 PROK1P58294 105 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 TPPP2P59282 170 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 FOXL1Q12952 345 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 CLINT1Q14677 625 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 C15orf32Q32M92 178 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 LCE2CQ5TA81 110 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF491Q8N8L2 437 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
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PDE4D-202ENST00000317118 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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PDE4D-202ENST00000317118 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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PDE4D-202ENST00000317118 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 SELENOTP62341 195 aa4.58□□□□□ -1.68
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PDE4D-202ENST00000317118 MLANAQ16655 118 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF329Q86UD4 541 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 BAP18Q8IXM2 172 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 OR4X2Q8NGF9 303 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 NPIPB3Q92617 1050 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 PHYHIPLQ96FC7 376 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-202ENST00000317118 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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