RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305510.3

CNNM3-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM3, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3-201ENST00000305510 PERPQ96FX8 193 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 MGST2Q99735 147 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 MGST3O14880 152 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 KLK10O43240 276 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 OSTCQ9NRP0 149 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 ZNF883P0CG24 379 aa14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 COL12A1Q99715 3063 aa14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 IZUMO1RA6ND01 250 aa14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 IGKV3-15P01624 115 aa14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 SIGMAR1Q99720 223 aa14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.74□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 H3BTX0 84 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 IGKV1-16P04430 117 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 VWC2Q2TAL6 325 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 Q8TCH9 128 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 OPRK1P41145 380 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 CCL3L1P16619 93 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 EFNB3Q15768 340 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 AHRRA9YTQ3 701 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 CEACAM3P40198 252 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 RAB9AP51151 201 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 TEPPQ6URK8 271 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 LRBAP50851 2863 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 ATP6V0BQ99437 205 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 OR52E5Q8NH55 327 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 JKAMPQ9P055 326 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 K7EM74 188 aa14.71□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 SPCS1Q9Y6A9 102 aa14.71□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.71□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.71□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.71□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 C11orf52Q96A22 123 aa14.71□□□□□ -0.05
CNNM3-201ENST00000305510 K7EP34 96 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 ISLRO14498 428 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 GFRA3O60609 400 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 A0A0G2JLM5 398 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 ZNF138P52744 262 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 LINC00479Q96M42 142 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 DSCAMO60469 2012 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 C9orf118A6NHY6 69 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 C15orf65H3BRN8 121 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 OR9G1Q8NH87 305 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 ZNF292O60281 2723 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 BLNKQ8WV28 456 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 CKS1BP61024 79 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 NUP35Q8NFH5 326 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 RNF7Q9UBF6 113 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 SRRM5B3KS81 715 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 MZT1Q08AG7 82 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 TCF24Q7RTU0 167 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 A6NDN8 102 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 MPDU1O75352 247 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 CSN3P07498 182 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 SEC11AP67812 179 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 HCP5Q6MZN7 132 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 HARBI1Q96MB7 349 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 A0A1W2PRE2 83 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 HSD52Q0P140 79 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 KIR3DS1Q14943 382 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 PET117Q6UWS5 81 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNNM3-201ENST00000305510 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms