RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589216.1

PTPN2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2, human

TSL 3

Gene PTPN2, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN2-208	ENST00000589216	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	TUBA4B	Q9H853	241 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216		H3BP45	60 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	LYRM1	O43325	122 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	OR4E1	P0C645	316 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	TFPI2	P48307	235 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF124	Q15973	351 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	ACY3	Q96HD9	319 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	GINS3	Q9BRX5	216 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	VSIR	Q9H7M9	311 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	TENM2	Q9NT68	2774 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN2-208	ENST00000589216	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	PRSS46	E5RG02	174 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	SLC25A4	P12235	298 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	SLC25A6	P12236	298 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	OR10J1	P30954	320 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	TCF24	Q7RTU0	167 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	NPIPB3	Q92617	1050 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	SPATA25	Q9BR10	227 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	NUDT15	Q9NV35	164 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	OR4C46	A6NHA9	309 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	WRB	O00258	174 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	CCS	O14618	274 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	DFFB	O76075	338 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	IFNA4	P05014	189 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	C4orf46	Q504U0	113 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	CCDC32	Q9BV29	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	ZMAT4	Q9H898	229 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216		U3KQ87	197 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	AGRN	O00468	2067 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	CENPX	A8MT69	81 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	SYNGR2	O43760	224 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	CCNK	O75909	580 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	TCRB	P04435	133 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	IL4	P05112	153 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	CRYBB3	P26998	211 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	P2RY1	P47900	373 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	IFITM3	Q01628	133 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	GAMT	Q14353	236 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	MITD1	Q8WV92	249 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	SSSCA1	O60232	199 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	TOMM40	O96008	361 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	PSG1	P11464	419 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	ID3	Q02535	119 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF90	Q03938	601 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	ASAH1	Q13510	395 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	COQ8A	Q8NI60	647 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	GLMP	Q8WWB7	406 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	METTL26	Q96S19	204 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216		U3KQE9	123 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	SCGB2A1	O75556	95 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	MED6	O75586	246 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	SCGB1D2	O95969	90 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	NPPC	P23582	126 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	PAX9	P55771	341 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	NOXA1	Q86UR1	476 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPN2-208	ENST00000589216	STPG3	Q8N7X2	389 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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