RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 C15orf32Q32M92 178 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 STPG3Q8N7X2 389 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 USMG5Q96IX5 58 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHG4P01861 327 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLC1P0CG04 106 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 M6PRP20645 277 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 MIC13Q5XKP0 118 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC39A9Q9NUM3 307 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD2BA6NFX1 497 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TRGV3P03979 118 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 ELLP55199 621 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZRG5 221 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 Q71RC1 249 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 RPRMQ9NS64 109 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG7O60262 68 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYBA1P05813 215 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM95Q3KNT9 176 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 CRLF1O75462 422 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5G2Q06055 141 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 BPIFCQ8NFQ6 507 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM213BQ8TBF2 198 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF502Q8TBZ5 544 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A10Q96PG2 267 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf24Q9BVV8 132 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JLM5 398 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00869P0C866 280 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 TPPP2P59282 170 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 Q56UQ5 140 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10G4Q8NGN3 311 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10G9Q8NGN4 311 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10G7Q8NGN6 311 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 VSIRQ9H7M9 311 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 YIF1AO95070 293 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 PF4V1P10720 104 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 PXDC1Q5TGL8 231 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZSV7 163 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 MED9Q9NWA0 146 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 F8P00451 2351 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMB11A5LHX3 300 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 F8W735 103 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ELANEP08246 267 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMB8P28062 276 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB2AP61019 212 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF90Q03938 601 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM209BQ5JX69 171 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX38Q6PEX7 206 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 COMMD1Q8N668 190 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 LYPD6BQ8NI32 183 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 SERTAD4Q9NUC0 356 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00862A6NCI5 91 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1-17P01599 117 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 FHITP49789 147 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB9AP51151 201 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF616Q08AN1 781 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX46H3BTG2 121 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 H2AFB1P0C5Y9 115 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXE3Q13461 319 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PFDN5Q99471 154 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC14L6B5MCN3 397 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PLP1P60201 277 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1L4Q8NGR5 311 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 GATAD1Q8WUU5 269 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF2Q99496 336 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 S4R3C0 116 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF21O43680 179 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TOMM40O96008 361 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 HBE1P02100 147 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFA5Q01523 94 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TIGITQ495A1 244 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD3L1Q8WWY6 194 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf95Q9H693 158 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PFDN2Q9UHV9 154 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT19A8MXV4 375 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 SPSB3Q6PJ21 355 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF329Q86UD4 541 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF152Q8N8N0 203 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC140Q96MF4 163 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPV4 95 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 RD3LP0DJH9 198 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOBP62745 196 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 KLK15Q9H2R5 256 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T8A6NH00 312 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CYSRT1A8MQ03 144 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CTSGP08311 255 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG1P11464 419 aa24.09■■□□□ 1.45
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