RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 UHRF2Q96PU4 802 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 CRYGBP07316 175 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 PPIAL4GP0DN37 164 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 NPPCP23582 126 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 CST9LP1Q5W188 147 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf82Q7Z2V1 217 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa20.34■□□□□ 0.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10W1Q8NGF6 305 aa20.32■□□□□ 0.84
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CAPNS1-204ENST00000587718 MEOX2P50222 304 aa20.31■□□□□ 0.84
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CAPNS1-204ENST00000587718 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa20.29■□□□□ 0.84
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CAPNS1-204ENST00000587718 CRYGCP07315 174 aa20.29■□□□□ 0.84
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR11H6Q8NGC7 330 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMB11A5LHX3 300 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 TCF21O43680 179 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RPEQ96AT9 228 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SIGLEC9Q9Y336 463 aa20.27■□□□□ 0.84
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CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PRE2 83 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLC7A0M8Q6 106 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTL6BO94805 426 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 MIR17HGQ75NE6 70 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf57Q99622 126 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A33Q9BSK2 321 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 E7EUB6 86 aa20.25■□□□□ 0.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 CEACAM3P40198 252 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 S100A12P80511 92 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXL1Q12952 345 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2BKO60814 126 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TRGC2P03986 189 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2BJP06899 126 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2BOP23527 126 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2BBP33778 126 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2BDP58876 126 aa20.24■□□□□ 0.83
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