RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 Q9HAA7 133 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 OTORQ9NRC9 128 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RARRES3Q9UL19 164 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 VSIG4Q9Y279 399 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 COQ4Q9Y3A0 265 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 C3P01024 1663 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PXDNLA1KZ92 1463 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 DOCK1Q14185 1865 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SLIT1O75093 1534 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 A0A087WZ39 114 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPM0 123 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF727A8MUV8 499 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 A8MWV9 139 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf98E9PRG8 122 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RRHO14718 337 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NGFP01138 241 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CXCL1P09341 107 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CRYGAP11844 174 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DOBP13765 273 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 OPRM1P35372 400 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MYCNOSP40205 109 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CCL23P55773 120 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 GFERP55789 205 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TAS2R45P59539 299 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CACNG7P62955 275 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RIGQ13278 110 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ELOCQ15369 112 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TRNP1Q6NT89 227 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 C22orf39Q6P5X5 142 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM91Q6ZNR0 172 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZVQ6 151 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 AAED1Q7RTV5 226 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00305Q7Z4B0 112 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A42Q86VD7 318 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A24Q8N4F4 322 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TOMM5Q8N4H5 51 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 OR2T10Q8NGZ9 312 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 OR9G1Q8NH87 305 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RTP4Q96DX8 246 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 MCEEQ96PE7 176 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SPACA5Q96QH8 159 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SCRT1Q9BWW7 348 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 GNB4Q9HAV0 340 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ESM1Q9NQ30 184 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 OR2W1Q9Y3N9 320 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 HES2Q9Y543 173 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RGPD1P0DJD0 1748 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa2.38□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa2.38□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 NDUFS5O43920 106 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RBMY1CP0DJD4 496 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PSMB2P49721 201 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 P2RX1P51575 399 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 QRFPP83859 136 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FOXF1Q12946 379 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CST6Q15828 149 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 COL24A1Q17RW2 1714 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SP6Q3SY56 376 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MPV17L2Q567V2 206 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SPRNQ5BIV9 151 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
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