RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567542.5

PRMT7-223, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, human

TSL 1 (best)

Gene PRMT7, Length 3,542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT7-223	ENST00000567542	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PGP	A6NDG6	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542		M0QZ24	198 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	MOS	P00540	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	IGKV3-15	P01624	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PRRX1	P54821	245 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	TCF24	Q7RTU0	167 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	ISLR	O14498	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	CD24	P25063	80 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	LOXL3	P58215	753 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	CBY3	A6NI87	242 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	IGLC3	P0DOY3	106 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	TCTA	P57738	103 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	TBR1	Q16650	682 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	C11orf52	Q96A22	123 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	hADV38S2	A0JD32	116 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	UPK2	O00526	184 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PPOX	P50336	477 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PRR20E	P86478	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PRR20C	P86479	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PRR20D	P86480	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PRR20B	P86481	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PRR20A	P86496	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	CCL17	Q92583	94 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PEX7	O00628	323 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	MMP23A	O75900	390 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PRCD	Q00LT1	54 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542		Q6ZS92	163 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71	5e-7	■■■■□ 24.9
PRMT7-223	ENST00000567542		A0A1W2PN81	502 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542		A0A1W2PRE2	83 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542		P01737	135 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	CCL3L1	P16619	93 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PLGLA	Q15195	96 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SSX8	Q7RTT4	187 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	NUDT11	Q96G61	164 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	LINC00614	P0C842	121 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	TMPRSS3	P57727	454 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	CD69	Q07108	199 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	LEMD1	Q68G75	181 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	DLL1	O00548	723 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC25A17	O43808	307 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	NUP35	Q8NFH5	326 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	NEUROG1	Q92886	237 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	VPS25	Q9BRG1	176 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRMT7-223	ENST00000567542	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.6	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms