RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552433.1

LETMD1-233, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 2

Gene LETMD1, Length 727 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-233	ENST00000552433	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433		H3BP45	60 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433		K7EP34	96 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	UQCRQ	O14949	82 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CECR9	P0C854	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	INPP1	P49441	399 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF83	P51522	516 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CACNG7	P62955	275 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433		Q0VG73	95 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	OR2A5	Q96R48	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433		F8W1H4	67 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	GABARAP	O95166	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	SHBG	P04278	402 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CRYBA2	P53672	197 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	GFER	P55789	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF90	Q03938	601 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	FCGR3A	P08637	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CFC1	P0CG37	223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	SDC2	P34741	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	LMO4	P61968	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	QRFP	P83859	136 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	PARL	Q9H300	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	GBF1	Q92538	1859 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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