RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.27□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ARL6Q9H0F7 186 aa6.27□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.27□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 FBXL17Q9UF56 701 aa6.27□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 CORTO00230 105 aa6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 BCL2L11O43521 198 aa6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 BRI3O95415 125 aa6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 CRYBA1P05813 215 aa6.26□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 S100A11P31949 105 aa6.26□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 HBG2P69892 147 aa6.26□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 VWC2Q2TAL6 325 aa6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 H3BUA1 57 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 I3L2K1 104 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 K7EIM0 57 aa6.25□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 CYB5BO43169 146 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 OR2J3O76001 311 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 NDUFB8O95169 186 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 NDUFA7O95182 113 aa6.25□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 OPRK1P41145 380 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 DEFA5Q01523 94 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 CLINT1Q14677 625 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 OPCMLQ14982 345 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ATP6V1FQ16864 119 aa6.25□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 GGACTQ9BVM4 153 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 GON7Q9BXV9 100 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 C16orf95Q9H693 158 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 MTORP42345 2549 aa6.25□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.24□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 PSMB8P28062 276 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 RHOGP84095 191 aa6.24□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ZNF329Q86UD4 541 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 NECAP1Q8NC96 275 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 LINC01006Q8NI28 216 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 MS4A10Q96PG2 267 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 KLK15Q9H2R5 256 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 THYN1Q9P016 225 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 CUBNO60494 3623 aa6.24□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 TMEM89A2RUT3 159 aa6.23□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 FAM223BA6NKX1 122 aa6.23□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 TRGV3P03979 118 aa6.23□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 TPPP2P59282 170 aa6.23□□□□□ -1.41
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BEST3-211ENST00000552295 ZNF266Q14584 549 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 C15orf32Q32M92 178 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 STOML3Q8TAV4 291 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.23□□□□□ -1.41
BEST3-211ENST00000552295 SLC35E1Q96K37 410 aa6.23□□□□□ -1.41
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