RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 HLA-DQA1P01909 254 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZS49 121 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 M0R3E3 92 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-209ENST00000550857 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-209ENST00000550857 F5H768 121 aa6.55□□□□□ -1.36
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