RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 GP9P14770 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 SMCO1Q147U7 214 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 NMSQ5H8A3 153 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 ZNF114Q8NC26 417 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 OR52E5Q8NH55 327 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 S100ZQ8WXG8 99 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 BATF3Q9NR55 127 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 C9orf170A2RU37 121 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 C2orf70A6NJV1 201 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 CTSGP08311 255 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 OR4E1P0C645 316 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 FOLR2P14207 255 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 CBLN1P23435 193 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 MFAP4P55083 255 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 SRPXP78539 464 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 AARDQ4LEZ3 155 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 OR1S1Q8NH92 325 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 CCDC32Q9BV29 185 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 RBKSQ9H477 322 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-217ENST00000550044 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GU03 582 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ADAP1O75689 374 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TCRBP04435 133 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 OPRK1P41145 380 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TNFRSF9Q07011 255 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 DHRS2Q13268 280 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ZNF846Q147U1 533 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 LRTM2Q8N967 370 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TMEM213A2RRL7 107 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 GNG7O60262 68 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 JTBO76095 146 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 YIF1AO95070 293 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 IFNA10P01566 189 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 HTR2BP41595 481 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 BSXQ3C1V8 233 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 C2orf83Q53S99 150 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 LYG2Q86SG7 212 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 DTD1Q8TEA8 209 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TXN2Q99757 166 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ZNF785A8K8V0 405 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 MPTX1A8MV57 137 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 CORTO00230 105 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 NDUFA4O00483 81 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 PITX3O75364 302 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TMEM50AO95807 157 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 IAPPP10997 89 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 NPBWR1P48145 328 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 IFITM3Q01628 133 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 GUCA2BQ16661 112 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 LCN12Q6JVE5 192 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 COQ8AQ8NI60 647 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ATP6V0BQ99437 205 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 MLXQ9UH92 298 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms