RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543721.1

LMO3-229, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2

Gene LMO3, Length 3,626 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-229	ENST00000543721	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721		F8W1H4	67 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	GNG7	O60262	68 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	MYO9B	Q13459	2157 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	PROP1	O75360	226 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	AZU1	P20160	251 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	MYCNOS	P40205	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	SRY	Q05066	204 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721		A0A1B0GUT8	65 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	FGF6	P10767	208 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	PRDX2	P32119	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	MPV17	P39210	176 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	HCFC1	P51610	2035 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	PGP	A6NDG6	321 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	LTA	P01374	205 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	COL8A1	P27658	744 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	VGLL1	Q99990	258 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721		H0Y8G0	127 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721		J3QL48	77 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	PF4V1	P10720	104 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	LTC4S	Q16873	150 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	WNT9B	O14905	357 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	MOS	P00540	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	CFHR2	P36980	270 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	LOXL3	P58215	753 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	LINC00205	P59089	165 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721		K7EQM0	130 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	CKS1B	P61024	79 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	TAL2	Q16559	108 aa		4.04	□□□□□ -1.76
LMO3-229	ENST00000543721	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76

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