RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 AKAP6Q13023 2319 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 APCP25054 2843 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 FABP7O15540 132 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR2A4O95047 310 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 FSTL3O95633 263 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 HPRT1P00492 218 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 CGB3P0DN86 165 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CGB7P0DN87 165 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 GUK1Q16774 197 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 OR2A7Q96R45 310 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 H7C1H1 209 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 CCNKO75909 580 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 CT45A10P0DMU9 189 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 GAFA1Q96PS6 74 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 GLS2Q9UI32 602 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 C12orf77C9JDV5 145 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 H2BFSP57053 126 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 HLA-DRB3P79483 266 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 LYG2Q86SG7 212 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF561Q8N587 486 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 NEK7Q8TDX7 302 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DL4Q99706 377 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 MED28Q9H204 178 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.15□□□□□ -1.91
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